יש מידה רבה של מוסדות להשכלה גבוהה ברחבי קירגיזסטן. זה כולל סביב שלושים ושבע אוניברסיטאות ציבוריות ושמונה עשר אוניברסיטאות פרטיות. בולטות אוניברסיטאות בקירגיזסטן כוללות את האוניברסיטה של ​​מרכז אסיה ובאוניברסיטה הלאומית הקירגיזית.

מוסדות אקדמיים ברחבי העולם מציעים תואר ראשון או בוגר במדעים. תואר ראשון פופולרי זה מועיל בהכנת תלמידים למקום העבודה או לתואר מתקדם. התואר הראשון הממוצע לוקח שלושה עד חמש שנים כדי להשלים.